Titre : |
Les plantes et leurs métabolites secondaires comme ersatz des antibiotiques ? Études in vitro et in silico |
Type de document : |
texte imprimé |
Auteurs : |
Gift Mathats,Bwalya, Auteur ; Bencheraiet, R, Directeur de thèse |
Editeur : |
Setif:UFA |
Année de publication : |
2018 |
Importance : |
1 vol 58 f .) |
Format : |
29 cm |
Langues : |
Français (fre) |
Catégories : |
Thèses & Mémoires:Chimie
|
Mots-clés : |
Extraits de plantes
Origanum glandulosum
flavonoïdes
ADN ligase
antibiotique |
Index. décimale : |
615.19 Chimie pharmaceutique |
Résumé : |
La sur utilisation des antibiotiques de synthèse a conduit à l'émergence de bactéries résistantes
qui sont devenues l’une des principales causes de décès dans le monde.
Pour éviter une situation d’impasse, la recherche de nouvelles structures antimicrobiennes
adéquates s’est orientée vers l’utilisation de composés extraits de plantes comme sources de
remèdes ciblant des sites autres que ceux utilisés par les antibiotiques conventionnels. Parmi le
grand nombre de molécules naturelles susceptibles de constituer des alternatives, les flavonoïdes
seraient des candidats éventuels pour jouer ce rôle.
C'est dans ce contexte que se situe ce travail qui consiste à évaluer l’effet inhibiteur de composés
naturels sur deux bactéries appartenant à un groupe critique que l’OMS considère comme
particulièrement menaçant.
Pour cela, deux études sont réalisées, l’une in vitro et l’autre in silico. En premier lieu, les
extraits d’une plante ubiquiste, l’origan, sont testés afin d’estimer leur activité antibactérienne.
Dans la seconde partie, il est question de l’inhibition de l’ADN ligase (LigA) par les flavonoïdes,
des métabolites secondaires des plantes. La (LigA), une enzyme responsable de la réplication de
certaines bactéries, représente une cible de choix dans le processus d’inhibition.
L’étude in vitro consiste à évaluer la sensibilité des extraits éthanoliques d'Origanum
glandulosum, par la méthode de diffusion sur milieu de culture, vis-à -vis de Staphylococcus
aureus et Pseudomonas aeruginosa, seuls ou en synergie.
Pour l’étape in silico, le docking moléculaire est utilisé. Ce dernier vise à prédire la formation du
complexe le plus stable résultant de l’interaction de la protéine avec les différents ligands pris
séparément.
Pour ce cas précis, la 4CC6 qui représente la structure cristallographique de l’ADN ligase de
S.aureus est sélectionnée comme entrée de la PDB. Une série de flavonoïdes, constituants de
l’origan, jouent le rôle de ligands.
Le docking est réalisé à l’aide de ArgusLab 4.01, un logiciel gratuit.
Les valeurs de l’énergie libre de formation (ΔGbinding) des complexes 4CC6/flavonoïdes et les
liaisons hydrogène établies servent à analyser les interactions entre les flavonoïdes et le site actif
de l’enzyme.
L’analyse des différentes interactions intervenant dans la formation des complexes et la
comparaison des énergies de ces derniers permet de dire que toutes les molécules expérimentées
présentent des valeurs, égales sinon supérieures à celles des complexes formés avec différents
antibiotiques |
Note de contenu : |
Sommaire
CHAPITRE 1 : Généralité sur les Bactérie et les Flavonoïdes…………………………...
1.1. Introduction…………………………………………………………………………….....
1.2. Les bactéries………………………………………………………………………………
I.2.1. Classification des bactéries……………………………………………………………...
1.2.2. Forme des bactéries…………………………………………………………………….
1.2.3. La constitution de la bactérie…………………………………………………………..
1.2.3.1. Structure extracellulaire ……………………………………………………………..
1.2.3.2. Structure intracellulaire……………………………………………………………….
1.2.4. Les inhibiteurs des bactéries…………………………………………………………….
1.2.4.1. Les inhibiteurs de synthèse (antibiotiques) ……………………………………….….
1.2.4.2. Les inhibiteurs naturels………………………………………………………………..
1.3. Les plantes et leurs extraits ………………………………………………………………
1.3.1. Des métabolites secondaires : Les polyphénols………………………………………...
1.3.2. Les flavonoïdes …………………………………………………………………………
1.3.2.1. Les flavonoïdes comme nutraceutiques………………………………………………
1.3.2.2. Structure et classification des flavonoïdes…………………………………………….
1.3.2.3. La biosynthèse ………………………………………………………………………..
1.3.2.4. Distribution……………………………………………………………………………
1.3.2.5. Propriétés des flavonoïdes…………………………………………………………….
1.3.2.6. L’activité antimicrobienne des flavonoïdes…………………………………………..
1.4. Synergie vs Antibiorésistance…………………………………………………………….
I.5. Relation flavonoïdes/Staphylococcus aureus et Pseudomonas aeruginosa………………
1.6. Conclusion………………………………………………………………………………..
CHAPITRE 2 : Etude in vitro Extrait de plante/ Bacterie………………………………...
2.1. Introduction……………………………………………………………………………….
2.2. Matériel végétal : Origanum glandulosum ……………………………………………….
2.2.1. Systématique d’Origanum glandulosum ………………………………………………
2.2.2. Vertus et composition chimique d’Origanum glandulosum…………………………….
2.2.3. Extraction et préparation des échantillons………………………………………………
2.3. Évaluation de l'activité antibactérienne et test de sensibilité……………………………...
2.3.1. Matériel bactériologique ………………………………………………………………..
2.3.2. Préparation des souches…………………………………………………………………
2.4. Lecture et analyse…………………………………………………………………………
2.5. Résultats et discussions…………………………………………………………………...
2.6. Conclusion………………………………………………………………………………...
|
Côte titre : |
MACH/0084 |
En ligne : |
https://drive.google.com/file/d/1npNw9DjrUrlQwa6WM09UM-9gLT-quy9i/view?usp=shari [...] |
Format de la ressource électronique : |
pdf |
Les plantes et leurs métabolites secondaires comme ersatz des antibiotiques ? Études in vitro et in silico [texte imprimé] / Gift Mathats,Bwalya, Auteur ; Bencheraiet, R, Directeur de thèse . - [S.l.] : Setif:UFA, 2018 . - 1 vol 58 f .) ; 29 cm. Langues : Français ( fre)
Catégories : |
Thèses & Mémoires:Chimie
|
Mots-clés : |
Extraits de plantes
Origanum glandulosum
flavonoïdes
ADN ligase
antibiotique |
Index. décimale : |
615.19 Chimie pharmaceutique |
Résumé : |
La sur utilisation des antibiotiques de synthèse a conduit à l'émergence de bactéries résistantes
qui sont devenues l’une des principales causes de décès dans le monde.
Pour éviter une situation d’impasse, la recherche de nouvelles structures antimicrobiennes
adéquates s’est orientée vers l’utilisation de composés extraits de plantes comme sources de
remèdes ciblant des sites autres que ceux utilisés par les antibiotiques conventionnels. Parmi le
grand nombre de molécules naturelles susceptibles de constituer des alternatives, les flavonoïdes
seraient des candidats éventuels pour jouer ce rôle.
C'est dans ce contexte que se situe ce travail qui consiste à évaluer l’effet inhibiteur de composés
naturels sur deux bactéries appartenant à un groupe critique que l’OMS considère comme
particulièrement menaçant.
Pour cela, deux études sont réalisées, l’une in vitro et l’autre in silico. En premier lieu, les
extraits d’une plante ubiquiste, l’origan, sont testés afin d’estimer leur activité antibactérienne.
Dans la seconde partie, il est question de l’inhibition de l’ADN ligase (LigA) par les flavonoïdes,
des métabolites secondaires des plantes. La (LigA), une enzyme responsable de la réplication de
certaines bactéries, représente une cible de choix dans le processus d’inhibition.
L’étude in vitro consiste à évaluer la sensibilité des extraits éthanoliques d'Origanum
glandulosum, par la méthode de diffusion sur milieu de culture, vis-à -vis de Staphylococcus
aureus et Pseudomonas aeruginosa, seuls ou en synergie.
Pour l’étape in silico, le docking moléculaire est utilisé. Ce dernier vise à prédire la formation du
complexe le plus stable résultant de l’interaction de la protéine avec les différents ligands pris
séparément.
Pour ce cas précis, la 4CC6 qui représente la structure cristallographique de l’ADN ligase de
S.aureus est sélectionnée comme entrée de la PDB. Une série de flavonoïdes, constituants de
l’origan, jouent le rôle de ligands.
Le docking est réalisé à l’aide de ArgusLab 4.01, un logiciel gratuit.
Les valeurs de l’énergie libre de formation (ΔGbinding) des complexes 4CC6/flavonoïdes et les
liaisons hydrogène établies servent à analyser les interactions entre les flavonoïdes et le site actif
de l’enzyme.
L’analyse des différentes interactions intervenant dans la formation des complexes et la
comparaison des énergies de ces derniers permet de dire que toutes les molécules expérimentées
présentent des valeurs, égales sinon supérieures à celles des complexes formés avec différents
antibiotiques |
Note de contenu : |
Sommaire
CHAPITRE 1 : Généralité sur les Bactérie et les Flavonoïdes…………………………...
1.1. Introduction…………………………………………………………………………….....
1.2. Les bactéries………………………………………………………………………………
I.2.1. Classification des bactéries……………………………………………………………...
1.2.2. Forme des bactéries…………………………………………………………………….
1.2.3. La constitution de la bactérie…………………………………………………………..
1.2.3.1. Structure extracellulaire ……………………………………………………………..
1.2.3.2. Structure intracellulaire……………………………………………………………….
1.2.4. Les inhibiteurs des bactéries…………………………………………………………….
1.2.4.1. Les inhibiteurs de synthèse (antibiotiques) ……………………………………….….
1.2.4.2. Les inhibiteurs naturels………………………………………………………………..
1.3. Les plantes et leurs extraits ………………………………………………………………
1.3.1. Des métabolites secondaires : Les polyphénols………………………………………...
1.3.2. Les flavonoïdes …………………………………………………………………………
1.3.2.1. Les flavonoïdes comme nutraceutiques………………………………………………
1.3.2.2. Structure et classification des flavonoïdes…………………………………………….
1.3.2.3. La biosynthèse ………………………………………………………………………..
1.3.2.4. Distribution……………………………………………………………………………
1.3.2.5. Propriétés des flavonoïdes…………………………………………………………….
1.3.2.6. L’activité antimicrobienne des flavonoïdes…………………………………………..
1.4. Synergie vs Antibiorésistance…………………………………………………………….
I.5. Relation flavonoïdes/Staphylococcus aureus et Pseudomonas aeruginosa………………
1.6. Conclusion………………………………………………………………………………..
CHAPITRE 2 : Etude in vitro Extrait de plante/ Bacterie………………………………...
2.1. Introduction……………………………………………………………………………….
2.2. Matériel végétal : Origanum glandulosum ……………………………………………….
2.2.1. Systématique d’Origanum glandulosum ………………………………………………
2.2.2. Vertus et composition chimique d’Origanum glandulosum…………………………….
2.2.3. Extraction et préparation des échantillons………………………………………………
2.3. Évaluation de l'activité antibactérienne et test de sensibilité……………………………...
2.3.1. Matériel bactériologique ………………………………………………………………..
2.3.2. Préparation des souches…………………………………………………………………
2.4. Lecture et analyse…………………………………………………………………………
2.5. Résultats et discussions…………………………………………………………………...
2.6. Conclusion………………………………………………………………………………...
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Côte titre : |
MACH/0084 |
En ligne : |
https://drive.google.com/file/d/1npNw9DjrUrlQwa6WM09UM-9gLT-quy9i/view?usp=shari [...] |
Format de la ressource électronique : |
pdf |
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