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Affiner la rechercheAmélioration de la croissance du blé dur en milieu salin par inoculation avec bacillus sp. et pantoea agglomerans isolées de sols / Hafsa Cherif / Sétif : Faculté des Sciences de la Nature et de la Vie (2014)
Titre : Amélioration de la croissance du blé dur en milieu salin par inoculation avec bacillus sp. et pantoea agglomerans isolées de sols Type de document : document électronique Auteurs : Hafsa Cherif, Auteur ; M Ghoul, Directeur de thèse Editeur : Sétif : Faculté des Sciences de la Nature et de la Vie Année de publication : 2014 Importance : 1 vol. (162 f.) / ill. en coul. Format : 30 cm. ISBN/ISSN/EAN : DOC/045 Langues : Français Catégories : Thèse et mémoire:Doctorat:Département de microbiologie Résumé : L’étude relative à l’inoculation des graines de blé dur par Bacillus sp et Pantoea agglomerans en présence de sel est réalisée dans le but d’apprécier l’effet positif desbn rhizobactéries favorisant la croissance des plantes (PGPR, plant growth promoting rhizobacteria) sur la vigueur et la productivité des cultures particulièrement lorsqu’elles sont soumises à un stress salin.
L’efficacité des inocula bactériens est liée à la caractérisation de multiples activités PGP telles que la production de l’acide indole acétique (AIA), du cyanure d’hydrogène (HCN), des sidérophores, de l’ammoniac (NH3), de la solubilisation des phosphates, de l’activité antifongique ainsi que de la capacité de synthétiser une ACC désaminase. Un total de 62 souches bactériennes (BG+ sporulés et BG-) sont isolées et sélectionnées à partir de trois sols rhizosphériques de régions arides et semi-arides.
La Majorité (>80%)des souches produisent du NH3. 75% des Bacillus inhibent trois souches fongiques et plus. 77% des BG- synthétisent des taux d’AIA ≥ 10µg/ml. Seules six souches possèdent une ACC-désaminase. La capacité de solubilisation des phosphates par des souches de Bacillus (n=10) testées sur milieu NBRIP décline en présence de NaCl. Cette activité reste faible sous stress salin et même en présence d’osmoprotecteurs : glycine-bétaine et proline (1mM).
Les Deux souches les plus performantes retenues et identifiées par séquençage du gène de l’ARNr16S sont Bacillus sp. sch1 et Pantoea agglomerans lma2.
Cette dernière possède un caractère halophile et exprime des activités PGP (production d’AIA de sidérophores et solubilisation des phosphates) élevées à des salinités comprises entre 100 et 400 mM de NaCl.
L’Iinoculation des graines de blé dur (variété Waha) par Bacillus sp. et/ou P. agglomerans, sous contrainte saline (0, 100 et 200mM/NaCl) améliorent nettement (P≤ 0,01) les paramètres morphologiques de la plante (poids frais et secs des racines et des feuilles, de l’allongement, racinaire et de l’élongation de la plante). Le poids sec des feuilles augmentent après inoculation par Bacillus sp. de 38% à 100mM et de 158% à 200 mM /NaCl. Les feuilles s’allongent de 27.31% pour Bacillus sp, 15.90% pour P. agglomerans et seulement 8.62% pour la co-inoculation. La synthèse de la chlorophylle est induite après inoculation quelle que soit la teneur en sel. L’accumulation de proline augmente à 200 mM/NaCl.
Elle chute en présence de P. agglomerans. Les taux de Na+ intracellulaires sont importants à 100 et 200 mM /NaCl. L’effet inhibiteur du sel sur l’absorption de K+ est atténué en présence d’inoculum bactérien. L’interaction entre salinité et inoculation bactérienne est positivement significative. Cependant la co-inoculation n’est pas synergique .
En Définitive, Bacillus sp.et P. agglomerans constituent des bioinoculants efficaces dans la restauration de la croissance du blé dur en zones arides et salées.En ligne : http://dspace.univ-setif.dz:8888/jspui/bitstream/123456789/1895/1/th%c3%a8se%20D [...] Amélioration de la croissance du blé dur en milieu salin par inoculation avec bacillus sp. et pantoea agglomerans isolées de sols [document électronique] / Hafsa Cherif, Auteur ; M Ghoul, Directeur de thèse . - Sétif : Faculté des Sciences de la Nature et de la Vie, 2014 . - 1 vol. (162 f.) / ill. en coul. ; 30 cm.
ISSN : DOC/045
Langues : Français
Catégories : Thèse et mémoire:Doctorat:Département de microbiologie Résumé : L’étude relative à l’inoculation des graines de blé dur par Bacillus sp et Pantoea agglomerans en présence de sel est réalisée dans le but d’apprécier l’effet positif desbn rhizobactéries favorisant la croissance des plantes (PGPR, plant growth promoting rhizobacteria) sur la vigueur et la productivité des cultures particulièrement lorsqu’elles sont soumises à un stress salin.
L’efficacité des inocula bactériens est liée à la caractérisation de multiples activités PGP telles que la production de l’acide indole acétique (AIA), du cyanure d’hydrogène (HCN), des sidérophores, de l’ammoniac (NH3), de la solubilisation des phosphates, de l’activité antifongique ainsi que de la capacité de synthétiser une ACC désaminase. Un total de 62 souches bactériennes (BG+ sporulés et BG-) sont isolées et sélectionnées à partir de trois sols rhizosphériques de régions arides et semi-arides.
La Majorité (>80%)des souches produisent du NH3. 75% des Bacillus inhibent trois souches fongiques et plus. 77% des BG- synthétisent des taux d’AIA ≥ 10µg/ml. Seules six souches possèdent une ACC-désaminase. La capacité de solubilisation des phosphates par des souches de Bacillus (n=10) testées sur milieu NBRIP décline en présence de NaCl. Cette activité reste faible sous stress salin et même en présence d’osmoprotecteurs : glycine-bétaine et proline (1mM).
Les Deux souches les plus performantes retenues et identifiées par séquençage du gène de l’ARNr16S sont Bacillus sp. sch1 et Pantoea agglomerans lma2.
Cette dernière possède un caractère halophile et exprime des activités PGP (production d’AIA de sidérophores et solubilisation des phosphates) élevées à des salinités comprises entre 100 et 400 mM de NaCl.
L’Iinoculation des graines de blé dur (variété Waha) par Bacillus sp. et/ou P. agglomerans, sous contrainte saline (0, 100 et 200mM/NaCl) améliorent nettement (P≤ 0,01) les paramètres morphologiques de la plante (poids frais et secs des racines et des feuilles, de l’allongement, racinaire et de l’élongation de la plante). Le poids sec des feuilles augmentent après inoculation par Bacillus sp. de 38% à 100mM et de 158% à 200 mM /NaCl. Les feuilles s’allongent de 27.31% pour Bacillus sp, 15.90% pour P. agglomerans et seulement 8.62% pour la co-inoculation. La synthèse de la chlorophylle est induite après inoculation quelle que soit la teneur en sel. L’accumulation de proline augmente à 200 mM/NaCl.
Elle chute en présence de P. agglomerans. Les taux de Na+ intracellulaires sont importants à 100 et 200 mM /NaCl. L’effet inhibiteur du sel sur l’absorption de K+ est atténué en présence d’inoculum bactérien. L’interaction entre salinité et inoculation bactérienne est positivement significative. Cependant la co-inoculation n’est pas synergique .
En Définitive, Bacillus sp.et P. agglomerans constituent des bioinoculants efficaces dans la restauration de la croissance du blé dur en zones arides et salées.En ligne : http://dspace.univ-setif.dz:8888/jspui/bitstream/123456789/1895/1/th%c3%a8se%20D [...] Exemplaires
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité DOC-E/045 DOC/045 DVD et CD Bibliothèque SNV Français Disponible D/064 DOC/045 Thése et Mémoir Bibliothèque SNV Français Disponible D/065 DOC/045 Thése et Mémoir Bibliothèque SNV Français Disponible
Titre : Effet d’osmoprotecteurs naturels sur la restauration de croissance de streptomyces et de plantes d’intérêt agricole sur sol salé ou aride Type de document : document électronique Auteurs : Hanane Ameur, Auteur ; M Ghoul, Directeur de thèse Editeur : Sétif : Faculté des Sciences de la Nature et de la Vie Année de publication : 2014 Importance : 1 vol. (XV-145 f.) / ill. Format : 30 cm. ISBN/ISSN/EAN : DOC/051 Langues : Français Catégories : Thèse et mémoire:Doctorat:Département de microbiologie Résumé :
Sept souches actinomycètales sont isolées d’un sol fertile de la région d’El-Ourissia (Nord de Sétif) sur le milieu amidon-caséine. La souche SF5 et celle de référence Nocardiopsis sp. MADO3 produisent les teneurs les plus élevées en acide indole acétique (55,58et 39,38µg/ml respectivement). Elles sont actives contre certains champignons et bactéries. Streptomyces sp. MADO2 (souche de référence) possède également cette activité antimicrobienne. Les colonies matures de la souche SF5 sont sèches, poudreuses, à bords plats et à contours irréguliers. Cette forme est caractéristique des colonies du genre Streptomyces. La couleur du mycélium aérien est blanche, tandis qu’elle est jaune sur mycélium végétatif, elles ont aussi une odeur du sol caractéristique du genre Streptomyces. En se basant sur les caractères morphologiques et culturaux, cet isolat est désigné comme étant Streptomyces.
Streptomyces sp. SF5 et les souches MADO2 et MADO3 sont halophiles modérées. La teneur en NaCl ainsi que la nature du milieu de culture influencent fortement sur leur halotolérance. L’effet osmoprotecteur de la glycine bétaine, de la proline et du tréhalose sur la restauration de la croissance de Streptomyces sp. et Nocardiopsis sp. est évident à des concentrations salines inhibitrices (500, 800 et 1000 mM), cependant, à de faibles osmolarités (100 mM), ils inhibent leur développement. L’extrait de Salsola vermiculata osmoprotège Streptomyces sp. SF5 et Streptomyces sp. MADO2 en présence de fortes teneurs de NaCl.
La germination de Triticum durum L, les longueurs des racines et des tiges, le poids sec des tiges, les teneurs en chlorophylles a, b et en caroténoïdes sont fortement inhibées par leNaCl, principalement à 200 mM. Cet effet est plus prononcé sur les paramètres étudiés en présence de S. vermiculata combinée avec Streptomyces sp. SF5. Les taux de germination sur sol en présence de NaCl (0, 100 et 200 mM) sont respectivement de 46.66%, 40% et 26.6% par comparaison aux témoins (100%, 80% et 53.2%). Cependant, l’apport séparé de S. vermiculata ou de Streptomyces sp.SF5 restaure efficacement la germination et la croissance de Triticum durum L. Les taux de germination sont respectivement de (86.6%, 86.6%) (100mM) et (86.6%, 93.2%) (200 mM) par rapport aux échantillons salés (80% et 53.2%). L’apport de cette halophyte et de Streptomyces sp. SF5 à des sols salés serait extrêmement utile pour lutter contre ce stress et améliorer les rendements agricoles.En ligne : http://dspace.univ-setif.dz:8888/jspui/bitstream/123456789/1822/1/Th%C3%A8se-Doc [...] Effet d’osmoprotecteurs naturels sur la restauration de croissance de streptomyces et de plantes d’intérêt agricole sur sol salé ou aride [document électronique] / Hanane Ameur, Auteur ; M Ghoul, Directeur de thèse . - Sétif : Faculté des Sciences de la Nature et de la Vie, 2014 . - 1 vol. (XV-145 f.) / ill. ; 30 cm.
ISSN : DOC/051
Langues : Français
Catégories : Thèse et mémoire:Doctorat:Département de microbiologie Résumé :
Sept souches actinomycètales sont isolées d’un sol fertile de la région d’El-Ourissia (Nord de Sétif) sur le milieu amidon-caséine. La souche SF5 et celle de référence Nocardiopsis sp. MADO3 produisent les teneurs les plus élevées en acide indole acétique (55,58et 39,38µg/ml respectivement). Elles sont actives contre certains champignons et bactéries. Streptomyces sp. MADO2 (souche de référence) possède également cette activité antimicrobienne. Les colonies matures de la souche SF5 sont sèches, poudreuses, à bords plats et à contours irréguliers. Cette forme est caractéristique des colonies du genre Streptomyces. La couleur du mycélium aérien est blanche, tandis qu’elle est jaune sur mycélium végétatif, elles ont aussi une odeur du sol caractéristique du genre Streptomyces. En se basant sur les caractères morphologiques et culturaux, cet isolat est désigné comme étant Streptomyces.
Streptomyces sp. SF5 et les souches MADO2 et MADO3 sont halophiles modérées. La teneur en NaCl ainsi que la nature du milieu de culture influencent fortement sur leur halotolérance. L’effet osmoprotecteur de la glycine bétaine, de la proline et du tréhalose sur la restauration de la croissance de Streptomyces sp. et Nocardiopsis sp. est évident à des concentrations salines inhibitrices (500, 800 et 1000 mM), cependant, à de faibles osmolarités (100 mM), ils inhibent leur développement. L’extrait de Salsola vermiculata osmoprotège Streptomyces sp. SF5 et Streptomyces sp. MADO2 en présence de fortes teneurs de NaCl.
La germination de Triticum durum L, les longueurs des racines et des tiges, le poids sec des tiges, les teneurs en chlorophylles a, b et en caroténoïdes sont fortement inhibées par leNaCl, principalement à 200 mM. Cet effet est plus prononcé sur les paramètres étudiés en présence de S. vermiculata combinée avec Streptomyces sp. SF5. Les taux de germination sur sol en présence de NaCl (0, 100 et 200 mM) sont respectivement de 46.66%, 40% et 26.6% par comparaison aux témoins (100%, 80% et 53.2%). Cependant, l’apport séparé de S. vermiculata ou de Streptomyces sp.SF5 restaure efficacement la germination et la croissance de Triticum durum L. Les taux de germination sont respectivement de (86.6%, 86.6%) (100mM) et (86.6%, 93.2%) (200 mM) par rapport aux échantillons salés (80% et 53.2%). L’apport de cette halophyte et de Streptomyces sp. SF5 à des sols salés serait extrêmement utile pour lutter contre ce stress et améliorer les rendements agricoles.En ligne : http://dspace.univ-setif.dz:8888/jspui/bitstream/123456789/1822/1/Th%C3%A8se-Doc [...] Exemplaires
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité DOC-E/051 DOC/051 DVD et CD Bibliothèque SNV Français Disponible D/076 DOC/051 Thése et Mémoir Bibliothèque SNV Français Disponible D/077 DOC/051 Thése et Mémoir Bibliothèque SNV Français Disponible
Titre : Effets du stress salin et d’osmoprotecteurs naturels sur la germination de blé dur (triticum durum) inoculé par pseudomonas fluorescens Type de document : document électronique Auteurs : Fouzia Arif, Auteur ; M Ghoul, Directeur de thèse Editeur : Sétif : Faculté des Sciences de la Nature et de la Vie Année de publication : 2015 Importance : 1 vol. (155 f.) / ill. Format : 30 cm. ISBN/ISSN/EAN : DOC/082 Langues : Français Catégories : Thèse et mémoire:Doctorat:Département de microbiologie Résumé :
La flore totale bactérienne et les Pseudomonas fluorescents de deux écosystèmes telluriques différents (blé et Atriplex halimus) sont évalués. Les numérations renseignent sur une richesse en bactéries des 2 rhizosphères. L’endosphère de Atriplex halimus abrite un nombre important d’espèces bactériennes. 23 isolats à Gram- présentant une fluorescence et des caractères biochimiques similaires à ceux des Pseudomonas fluorescents spp. sont retenus. Ils produisent des molécules bioactives stimulant la croissance végétale (acide indole acétique, sidérophoeres, ammoniac) et solubilisent les phosphates. La majorité exerce une activité inhibitrice vis-à -vis de 2 champignons phytopathogènes : Fusarium oxysporum et Alternaria alternata, produit l’acide cyanhydrique et possède une protéase. Quatre souches sont identifiées comme Pseudomonas putida AF2, P. aeruginosa RB5, P. fluorescens RB13 et P.
aeruginaosa EH4, par séquençage de l’ARNr 16S. Inhibées à 500 mM/ NaCl, la croissance des 4 souches est restaurée par un apport exogène de glycine bétaine et de Proline (1 mM). L’extrait de l’algue U. lactuca (au 1/ 100ème) exerce un effet plus fort que les 2 molécules synthétiques. Tandis que celui de A.halimus n’apporte pas d’osmoprotection. En présence de 800 mM l’inhibition est totale quelles que soient les conditions. L’inoculation du blé dur Mohamed Ben Bachir par P. fluorescens RB13, P. fluorescens CHAO, isolément ou en culture mixte, en présence d’osmoprotecteurs [glycine bétaine, proline (5 mM) et extrait d’algue (3%)], augmente le taux cumulé de germination et la biomasse des plantes. La coinoculation a un effet synergique évident par l’obtention d’un rendement maximal. In vitro, sur milieu de germination MS, les caractéristiques morpho-biochimiques sont significativement améliorées chez le blé co-inoculé et sous stress salin de 200 mM/ NaCl.
L’effet synergique de la co-inoculation et de U. lactuca restaure considérablement les paramètres étudiés (biomasse, taux de proline, de chlorophylle et de caroténoides). Ces résultats sont en faveur d’une inoculation des graines de blé par des souches actives et halotolérantes de P. fluorescens. Une supplémentation en smoprotecteurs naturels provenant de U. lactuca serait très bénéfique pour une agriculture durable dans les sols affectés par la
salinité.En ligne : http://dspace.univ-setif.dz:8888/jspui/bitstream/123456789/1653/1/th%c3%a8se%20s [...] Effets du stress salin et d’osmoprotecteurs naturels sur la germination de blé dur (triticum durum) inoculé par pseudomonas fluorescens [document électronique] / Fouzia Arif, Auteur ; M Ghoul, Directeur de thèse . - Sétif : Faculté des Sciences de la Nature et de la Vie, 2015 . - 1 vol. (155 f.) / ill. ; 30 cm.
ISSN : DOC/082
Langues : Français
Catégories : Thèse et mémoire:Doctorat:Département de microbiologie Résumé :
La flore totale bactérienne et les Pseudomonas fluorescents de deux écosystèmes telluriques différents (blé et Atriplex halimus) sont évalués. Les numérations renseignent sur une richesse en bactéries des 2 rhizosphères. L’endosphère de Atriplex halimus abrite un nombre important d’espèces bactériennes. 23 isolats à Gram- présentant une fluorescence et des caractères biochimiques similaires à ceux des Pseudomonas fluorescents spp. sont retenus. Ils produisent des molécules bioactives stimulant la croissance végétale (acide indole acétique, sidérophoeres, ammoniac) et solubilisent les phosphates. La majorité exerce une activité inhibitrice vis-à -vis de 2 champignons phytopathogènes : Fusarium oxysporum et Alternaria alternata, produit l’acide cyanhydrique et possède une protéase. Quatre souches sont identifiées comme Pseudomonas putida AF2, P. aeruginosa RB5, P. fluorescens RB13 et P.
aeruginaosa EH4, par séquençage de l’ARNr 16S. Inhibées à 500 mM/ NaCl, la croissance des 4 souches est restaurée par un apport exogène de glycine bétaine et de Proline (1 mM). L’extrait de l’algue U. lactuca (au 1/ 100ème) exerce un effet plus fort que les 2 molécules synthétiques. Tandis que celui de A.halimus n’apporte pas d’osmoprotection. En présence de 800 mM l’inhibition est totale quelles que soient les conditions. L’inoculation du blé dur Mohamed Ben Bachir par P. fluorescens RB13, P. fluorescens CHAO, isolément ou en culture mixte, en présence d’osmoprotecteurs [glycine bétaine, proline (5 mM) et extrait d’algue (3%)], augmente le taux cumulé de germination et la biomasse des plantes. La coinoculation a un effet synergique évident par l’obtention d’un rendement maximal. In vitro, sur milieu de germination MS, les caractéristiques morpho-biochimiques sont significativement améliorées chez le blé co-inoculé et sous stress salin de 200 mM/ NaCl.
L’effet synergique de la co-inoculation et de U. lactuca restaure considérablement les paramètres étudiés (biomasse, taux de proline, de chlorophylle et de caroténoides). Ces résultats sont en faveur d’une inoculation des graines de blé par des souches actives et halotolérantes de P. fluorescens. Une supplémentation en smoprotecteurs naturels provenant de U. lactuca serait très bénéfique pour une agriculture durable dans les sols affectés par la
salinité.En ligne : http://dspace.univ-setif.dz:8888/jspui/bitstream/123456789/1653/1/th%c3%a8se%20s [...] Exemplaires
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité DOC-E/082 DOC/082 DVD et CD Bibliothèque SNV Français Disponible D/128 DOC/082 Thése et Mémoir Bibliothèque SNV Français Disponible D/129 DOC/082 Thése et Mémoir Bibliothèque SNV Français Disponible
