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Auteur Denis Tagu (1961-....) |
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Affiner la rechercheBio-informatique / Versailles : Éd. Quae (2010)
Titre : Bio-informatique : principes d'utilisation des outils Type de document : texte imprimé Auteurs : Denis Tagu (1961-....), Directeur de publication, rédacteur en chef ; Jean-Loup Risler (1943-....), Directeur de publication, rédacteur en chef Editeur : Versailles : Éd. Quae Année de publication : 2010 Collection : Savoir-faire (Paris. 2006), ISSN 1952-1251 Importance : 1 vol. (VII-270 p.) Présentation : ill., couv. ill. en coul. Format : 24 cm ISBN/ISSN/EAN : 978-2-7592-0870-8 Note générale : Notes bibliogr. Notes webliogr. Langues : Français Catégories : Bio-informatique - Biostatistiques - Biomathématique - Mathématique - Informatique Mots-clés : - Bio-informatique
- Bioinformatique
- Biologie : Bases de données
- Biologie informatiqueIndex. décimale : 570.2 Ouvrages divers en relation avec la biologie et les sciences de la vie Résumé :
A l'interface entre la biologie et l'informatique, la bio-informatique et ses outils font aujourd'hui partie du " paysage " des laboratoires qui s'intéressent de près ou de loin à la structure, au fonctionnement et à l'évolution des génomes. Pour tous ceux qui oeuvrent au sein de tels laboratoires, s'approprier les outils d'analyse, de stockage et de visualisation des séquences d'acides nucléiques et d'acides aminés est devenu une nécessité.
Il ne s'agit pas ici d'apprendre à programmer, mais de comprendre les outils à disposition et leur principe de fonctionnement afin de choisir le plus approprié. L'ouvrage est structuré de manière extrêmement lisible en cinquante-huit fiches regroupées thématiquement. Etudiées pour que le lecteur accède efficacement à l'information recherchée, les fiches trouvent matière à approfondissement, à la fin de chaque thématique, sous la forme d'une sélection de références à des articles scientifiques, à des ouvrages et à des sites Internet.
Ce livre a été conçu pour des biologistes, quel que soit leur niveau de connaissance en génomique, qui travaillent sur des projets de biologie moléculaire, de génomique ou de génétiqueNote de contenu :
Sommaire
1- GENERALITES
2- BANQUES ET BASES DE DONNEES EN BIOLOGIE
3- ALIGNEMENT DES SEQUENCES
4- DOMAINES PROTEIQUES
5- RECONSTRUCTION PHYLOGENETIQUE
6- ANNOTATION DES GENOMES
7- COMPARAISON DES GENOMES
8- ANALYSE DU TRANCRIPTOME.Bio-informatique : principes d'utilisation des outils [texte imprimé] / Denis Tagu (1961-....), Directeur de publication, rédacteur en chef ; Jean-Loup Risler (1943-....), Directeur de publication, rédacteur en chef . - Versailles : Éd. Quae, 2010 . - 1 vol. (VII-270 p.) : ill., couv. ill. en coul. ; 24 cm. - (Savoir-faire (Paris. 2006), ISSN 1952-1251) .
ISBN : 978-2-7592-0870-8
Notes bibliogr. Notes webliogr.
Langues : Français
Catégories : Bio-informatique - Biostatistiques - Biomathématique - Mathématique - Informatique Mots-clés : - Bio-informatique
- Bioinformatique
- Biologie : Bases de données
- Biologie informatiqueIndex. décimale : 570.2 Ouvrages divers en relation avec la biologie et les sciences de la vie Résumé :
A l'interface entre la biologie et l'informatique, la bio-informatique et ses outils font aujourd'hui partie du " paysage " des laboratoires qui s'intéressent de près ou de loin à la structure, au fonctionnement et à l'évolution des génomes. Pour tous ceux qui oeuvrent au sein de tels laboratoires, s'approprier les outils d'analyse, de stockage et de visualisation des séquences d'acides nucléiques et d'acides aminés est devenu une nécessité.
Il ne s'agit pas ici d'apprendre à programmer, mais de comprendre les outils à disposition et leur principe de fonctionnement afin de choisir le plus approprié. L'ouvrage est structuré de manière extrêmement lisible en cinquante-huit fiches regroupées thématiquement. Etudiées pour que le lecteur accède efficacement à l'information recherchée, les fiches trouvent matière à approfondissement, à la fin de chaque thématique, sous la forme d'une sélection de références à des articles scientifiques, à des ouvrages et à des sites Internet.
Ce livre a été conçu pour des biologistes, quel que soit leur niveau de connaissance en génomique, qui travaillent sur des projets de biologie moléculaire, de génomique ou de génétiqueNote de contenu :
Sommaire
1- GENERALITES
2- BANQUES ET BASES DE DONNEES EN BIOLOGIE
3- ALIGNEMENT DES SEQUENCES
4- DOMAINES PROTEIQUES
5- RECONSTRUCTION PHYLOGENETIQUE
6- ANNOTATION DES GENOMES
7- COMPARAISON DES GENOMES
8- ANALYSE DU TRANCRIPTOME.Exemplaires
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité FB/01945 SNV8/0605 -Livre- Bibliothèque SNV -Français- Disponible FB/01946 SNV8/0605 -Livre- Bibliothèque SNV -Français- Disponible FB/07085 SNV8/0605 -Livre- Bibliothèque SNV -Français- Disponible FB/07086 SNV8/0605 -Livre- Bibliothèque SNV -Français- Disponible FB/07087 SNV8/0605 -Livre- Bibliothèque SNV -Français- Disponible Principes des techniques de biologie moléculaire / Denis Tagu / Versailles : Quae (2003)
Titre : Principes des techniques de biologie moléculaire Type de document : texte imprimé Auteurs : Denis Tagu (1961-....), Directeur de publication, rédacteur en chef ; Christian Moussard (1952-....), Directeur de publication, rédacteur en chef ; Leonardo K. Basco (1957-....), Donateur Editeur : Versailles : Quae Année de publication : 2003 Collection : Mieux comprendre Importance : 1 vol. (176 p.) Présentation : ill., couv. ill. en coul. Format : 24 cm ISBN/ISSN/EAN : 978-2-7380-1067-4 Langues : Français Mots-clés : - Biologie moléculaire : Principes des technique
- Génétique moléculaireIndex. décimale : 572.8 Génétique moléculaire ( biologie moléculaire, cytogénétique, génétique biochimique) Résumé :
La Biologie moléculaire a bouleversé les sciences du vivant L'explosion de la génomique, qui propose des séquences de génomes entiers ainsi que des approches globales de leur fonctionnement, en est un exemple récent. L'objectif de cet ouvrage présenté sous forme de fiches n'est pas de détailler des protocoles ou des recettes toutes faites, mais d'expliquer simplement les principes théoriques des techniques de biologie moléculaire. Cette édition mise à jour propose des illustrations nouvelles et présente notamment de nombreuses techniques de génomique récemment apparues dans les laboratoires. Cet ouvrage s'adresse à toute personne - spécialiste ou non - curieuse de connaître les bases des différentes techniques de manipulation des acides nucléiques.Note de contenu :
Sommaire:
Structure et expression d'un gène eucaryote codant un ARNm et une protéine
Paramètres de description d'un génome
Séquençage de génomes entiers
VECTEURS ET CLONAGE
Enzymes de restriction
Electrophorèse des acides nucléiques
Description d'un plasmide et d'un phagemide
Description d'un bactériophage et d'un cosmide
Description d'un YAC et autres grands vecteurs
Clonage moléculaire
Transformation génétique des bactéries et des levures
MARQUAGE D'ACIDES NUCLEIQUES ET HYBRIDATIONS
Marquage de l'ADN
Hybridation moléculaire
Hybridation in situ des ARNm
BANQUES D'ADN ET CRIBLAGE
Construction d'une banque d'ADN génomique
Construction d'une banque d'ADNc
Criblage d'une banque
Criblage différentiel : banques d'ADNc soustraites, AFLP-ADNc
Criblage différentiel par DD RT-PCR : tri d'ARNm (differential display RT-PCR)
Criblage différentiel par SSH : hybridation soustractive et suppressive (suppression substractive hybridization)
Criblage différentiel par RDA : analyse par différence de représentation (representational différence analysis)
EST : étiquettes de gènes exprimés (expressed sequence tags)
Réseaux d'ADN: puces à ADN, filtres d'ADNc
CARACTERISATION D'UN GENE
Séquençage d'ADN
PCR (polymerase chain réaction)
RACE : amplification rapide d'extrémités d'ADNc (rapid amplification of cDNAs ends)
Marche génomique par PCR
RT-PCR : PCR sur ARNm (reverse transcriptase PCR)
Transcription in vitro
Détermination du site d'initiation de la transcription 30
Analyse fonctionnelle de promoteurs
Gel-retard
Empreinte à la DNase I (footprinting) TRANSFORMATIONS GENETIQUES D'EUCARYOTES
Transformation génétique des végétaux par Agrobacterium tumefaciens
Transfert direct de gènes dans des protoplastes végétaux
Transfert direct de gènes par biolistique
Transformation génétique de cellules animales
Le clonage des animaux
Expression transitoire
ANALYSE DE LA FONCTION D'UN GENE
Protéines recombinantes
Les baculovirus d'insectes, vecteurs d'expression de gènes étrangers
Système du double hybride
Mutagenèse dirigée
Complémentation de mutation chez la Levure
Inactivation de gènes (knock-out)
Étiquetage moléculaire
RNAi : inactivation de gènes par interférence d'ADN (RNA interférence)
POLYMORPHISME D'UN GENOME
Marqueurs génétiques moléculaires
Cartes génétique et physique
PFGE : électrophorèse en champs pulsés (pulse field electrophoresis)
RFLP : polymorphisme de longueur des fragments de restriction (restriction fragment length polymorphism)
RAPD : polymorphisme d'ADN par amplification aléatoire (random amplified polymorphic DNA)
AFLP : polymorphisme de longueur de fragments amplifiés (amplified fragment length polymorphism)
Les rétromarqueurs
SSCP : polymorphisme de conformation de l'ADN monocaténaire (single strand conformation polymorphism)
DGGE : électrophorèse de l'ADN en gradient de gel dénaturant (denaturing gel gradient electrophoresis)
SNP : polymorphisme d'un seul nucléotide (single nucleotide polymorphism)
SSR : microsatellites, répétitions de séquences simples (simple sequence repeats)Principes des techniques de biologie moléculaire [texte imprimé] / Denis Tagu (1961-....), Directeur de publication, rédacteur en chef ; Christian Moussard (1952-....), Directeur de publication, rédacteur en chef ; Leonardo K. Basco (1957-....), Donateur . - Versailles : Quae, 2003 . - 1 vol. (176 p.) : ill., couv. ill. en coul. ; 24 cm. - (Mieux comprendre) .
ISBN : 978-2-7380-1067-4
Langues : Français
Mots-clés : - Biologie moléculaire : Principes des technique
- Génétique moléculaireIndex. décimale : 572.8 Génétique moléculaire ( biologie moléculaire, cytogénétique, génétique biochimique) Résumé :
La Biologie moléculaire a bouleversé les sciences du vivant L'explosion de la génomique, qui propose des séquences de génomes entiers ainsi que des approches globales de leur fonctionnement, en est un exemple récent. L'objectif de cet ouvrage présenté sous forme de fiches n'est pas de détailler des protocoles ou des recettes toutes faites, mais d'expliquer simplement les principes théoriques des techniques de biologie moléculaire. Cette édition mise à jour propose des illustrations nouvelles et présente notamment de nombreuses techniques de génomique récemment apparues dans les laboratoires. Cet ouvrage s'adresse à toute personne - spécialiste ou non - curieuse de connaître les bases des différentes techniques de manipulation des acides nucléiques.Note de contenu :
Sommaire:
Structure et expression d'un gène eucaryote codant un ARNm et une protéine
Paramètres de description d'un génome
Séquençage de génomes entiers
VECTEURS ET CLONAGE
Enzymes de restriction
Electrophorèse des acides nucléiques
Description d'un plasmide et d'un phagemide
Description d'un bactériophage et d'un cosmide
Description d'un YAC et autres grands vecteurs
Clonage moléculaire
Transformation génétique des bactéries et des levures
MARQUAGE D'ACIDES NUCLEIQUES ET HYBRIDATIONS
Marquage de l'ADN
Hybridation moléculaire
Hybridation in situ des ARNm
BANQUES D'ADN ET CRIBLAGE
Construction d'une banque d'ADN génomique
Construction d'une banque d'ADNc
Criblage d'une banque
Criblage différentiel : banques d'ADNc soustraites, AFLP-ADNc
Criblage différentiel par DD RT-PCR : tri d'ARNm (differential display RT-PCR)
Criblage différentiel par SSH : hybridation soustractive et suppressive (suppression substractive hybridization)
Criblage différentiel par RDA : analyse par différence de représentation (representational différence analysis)
EST : étiquettes de gènes exprimés (expressed sequence tags)
Réseaux d'ADN: puces à ADN, filtres d'ADNc
CARACTERISATION D'UN GENE
Séquençage d'ADN
PCR (polymerase chain réaction)
RACE : amplification rapide d'extrémités d'ADNc (rapid amplification of cDNAs ends)
Marche génomique par PCR
RT-PCR : PCR sur ARNm (reverse transcriptase PCR)
Transcription in vitro
Détermination du site d'initiation de la transcription 30
Analyse fonctionnelle de promoteurs
Gel-retard
Empreinte à la DNase I (footprinting) TRANSFORMATIONS GENETIQUES D'EUCARYOTES
Transformation génétique des végétaux par Agrobacterium tumefaciens
Transfert direct de gènes dans des protoplastes végétaux
Transfert direct de gènes par biolistique
Transformation génétique de cellules animales
Le clonage des animaux
Expression transitoire
ANALYSE DE LA FONCTION D'UN GENE
Protéines recombinantes
Les baculovirus d'insectes, vecteurs d'expression de gènes étrangers
Système du double hybride
Mutagenèse dirigée
Complémentation de mutation chez la Levure
Inactivation de gènes (knock-out)
Étiquetage moléculaire
RNAi : inactivation de gènes par interférence d'ADN (RNA interférence)
POLYMORPHISME D'UN GENOME
Marqueurs génétiques moléculaires
Cartes génétique et physique
PFGE : électrophorèse en champs pulsés (pulse field electrophoresis)
RFLP : polymorphisme de longueur des fragments de restriction (restriction fragment length polymorphism)
RAPD : polymorphisme d'ADN par amplification aléatoire (random amplified polymorphic DNA)
AFLP : polymorphisme de longueur de fragments amplifiés (amplified fragment length polymorphism)
Les rétromarqueurs
SSCP : polymorphisme de conformation de l'ADN monocaténaire (single strand conformation polymorphism)
DGGE : électrophorèse de l'ADN en gradient de gel dénaturant (denaturing gel gradient electrophoresis)
SNP : polymorphisme d'un seul nucléotide (single nucleotide polymorphism)
SSR : microsatellites, répétitions de séquences simples (simple sequence repeats)Exemplaires
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité FB/00949 SNV8/0247 -Livre- Bibliothèque SNV -Français- Disponible FB/00950 SNV8/0247 -Livre- Bibliothèque SNV -Français- Disponible FB/00951 SNV8/0247 -Livre- Bibliothèque SNV -Français- Disponible Principes des techniques de biologie moléculaire et génomique / Versailles : Éditions Quae (2018)
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Titre : Principes des techniques de biologie moléculaire et génomique Type de document : texte imprimé Auteurs : Denis Tagu (1961-....), Editeur scientifique ; Stéphanie Jaubert-Possamai, Editeur scientifique ; Agnès Méreau, Editeur scientifique Mention d'édition : 3e éd. revue et augmentée Editeur : Versailles : Éditions Quae Année de publication : 2018 Importance : 1 vol. (312 p.) Présentation : ill. en coul. Format : 24 cm ISBN/ISSN/EAN : 978-2-7592-2885-0 Langues : Français Catégories : Biologie ( B-Cellulaire - B-Animale - B-Végétale - B-moléculaire - Cytologie ) Mots-clés : - Biologie moléculaire Génétique moléculaire Index. décimale : 572.8 Génétique moléculaire ( biologie moléculaire, cytogénétique, génétique biochimique) Résumé :
Cet ouvrage didactique présente, sous forme de fiches, les principales techniques utilisées dans les laboratoires pour étudier le fonctionnement du vivant via les acides nucléiques. Après quelques définitions et généralités sur la structure des gènes, on y décrit les techniques de base en biologie moléculaire et génomique. Ces techniques consistent à extraire les acides nucléiques, à les découper, à récupérer des fragments d'intérêt et à les visualiser. Il s'agit également de les manipuler grâce aux techniques de clonage et de PCR (Polymerase Chain Reaction). Parmi les applications, le séquençage est une technique qui a grandement évolué ces quinze dernières années et qui n'est toujours pas stabilisée : nous aborderons ici les techniques de séquençages actuellement commercialisées et accessibles via des plateformes publiques ou privées. Autre application majeure, la manipulation des gènes par transformation génétique et mutagenèse permet une étude fine de leur fonctionnement. Plusieurs techniques de transformation génétique existent dont la nouvelle technique d'édition des génomes (CRISPR-Cas9) qui est décrite dans cet ouvrage. Enfin, la plupart des approches font maintenant appel à des stratégies dites 'haut débit'. L'analyse des données ainsi générées nécessite de recourir à la bioanalyse et à la bioinformatique : cet ouvrage ne vise pas à donner toutes les bases de ces analyses, mais quelques explications y sont détaillées. Cette 3e édition revue et augmentée s'adresse aux étudiants et aux enseignants, ainsi qu'aux personnels travaillant dans les laboratoires manipulant les acides nucléiques.Note de contenu :
Sommaire:
- Les bases
- Caractérisation d'un gène
- Analyse de la fonction d'un gène par mutagenèse ou transgenèse
- Approches haut-débits
- Étude du polymorphisme d'un génome
- BioanalysesPrincipes des techniques de biologie moléculaire et génomique [texte imprimé] / Denis Tagu (1961-....), Editeur scientifique ; Stéphanie Jaubert-Possamai, Editeur scientifique ; Agnès Méreau, Editeur scientifique . - 3e éd. revue et augmentée . - Versailles : Éditions Quae, 2018 . - 1 vol. (312 p.) : ill. en coul. ; 24 cm.
ISBN : 978-2-7592-2885-0
Langues : Français
Catégories : Biologie ( B-Cellulaire - B-Animale - B-Végétale - B-moléculaire - Cytologie ) Mots-clés : - Biologie moléculaire Génétique moléculaire Index. décimale : 572.8 Génétique moléculaire ( biologie moléculaire, cytogénétique, génétique biochimique) Résumé :
Cet ouvrage didactique présente, sous forme de fiches, les principales techniques utilisées dans les laboratoires pour étudier le fonctionnement du vivant via les acides nucléiques. Après quelques définitions et généralités sur la structure des gènes, on y décrit les techniques de base en biologie moléculaire et génomique. Ces techniques consistent à extraire les acides nucléiques, à les découper, à récupérer des fragments d'intérêt et à les visualiser. Il s'agit également de les manipuler grâce aux techniques de clonage et de PCR (Polymerase Chain Reaction). Parmi les applications, le séquençage est une technique qui a grandement évolué ces quinze dernières années et qui n'est toujours pas stabilisée : nous aborderons ici les techniques de séquençages actuellement commercialisées et accessibles via des plateformes publiques ou privées. Autre application majeure, la manipulation des gènes par transformation génétique et mutagenèse permet une étude fine de leur fonctionnement. Plusieurs techniques de transformation génétique existent dont la nouvelle technique d'édition des génomes (CRISPR-Cas9) qui est décrite dans cet ouvrage. Enfin, la plupart des approches font maintenant appel à des stratégies dites 'haut débit'. L'analyse des données ainsi générées nécessite de recourir à la bioanalyse et à la bioinformatique : cet ouvrage ne vise pas à donner toutes les bases de ces analyses, mais quelques explications y sont détaillées. Cette 3e édition revue et augmentée s'adresse aux étudiants et aux enseignants, ainsi qu'aux personnels travaillant dans les laboratoires manipulant les acides nucléiques.Note de contenu :
Sommaire:
- Les bases
- Caractérisation d'un gène
- Analyse de la fonction d'un gène par mutagenèse ou transgenèse
- Approches haut-débits
- Étude du polymorphisme d'un génome
- BioanalysesExemplaires
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité FB/12478 SNV8/1456 Livre Bibliothèque SNV Français Disponible FB/12479 SNV8/1456 Livre Bibliothèque SNV Français Disponible FB/12480 SNV8/1456 Livre Bibliothèque SNV Français Disponible FB/12481 SNV8/1456 Livre Bibliothèque SNV Français Disponible FB/12482 SNV8/1456 Livre Bibliothèque SNV Français Disponible FB/12483 SNV8/1456 Livre Bibliothèque SNV Français Disponible FB/12484 SNV8/1456 Livre Bibliothèque SNV Français Disponible FB/12485 SNV8/1456 Livre Bibliothèque SNV Français Disponible Documents numériques
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