Résumé :
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L'intestin humain abrite 10^14 bactéries et de nombreux autres micro-organismes tels que des archées, des virus et des champignons. L'étude du microbiote intestinal a révélé comment cette entité participe à la physiologie intestinale et, plus encore, à la santé humaine, agissant comme un véritable « organe caché ». Dans cette revue, nous visons à apporter des informations sur le microbiote intestinal, sa structure, ses rôles et son implication dans la pathologie humaine.
Après la colonisation bactérienne chez le nourrisson, la composition microbienne intestinale devient unique pour chaque individu, bien que plus de 95 % puisse être attribué à quatre phylums principaux. L'utilisation de méthodes indépendantes de la culture et, plus récemment, le développement du séquençage à haut débit et de la technique NGS ont permis de décrire précisément la structure et la diversité du microbiote intestinal ainsi que ses altérations dans les maladies. Le microbiote intestinal est impliqué dans la maturation du système immunitaire de l'hôte et dans de nombreuses voies métaboliques fondamentales, notamment la fermentation des sucres et des protéines, le métabolisme des acides biliaires et des xénobiotiques. Le déséquilibre des populations microbiennes intestinales, ou dysbiose, a des conséquences fonctionnelles importantes et est impliqué dans de nombreuses maladies digestives (maladies inflammatoires chroniques de l'intestin, cancer colorectal, etc.) mais aussi dans l'obésité et les maladies cardiovasculaires.
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